SIBO direkt ya da dolaylı olarak aşağıdaki rahatsızlıklara yol açabilir ya da bu rahatsızlığı besliyor olabilir:

IBS (huzursuz bağırsak sendromu)
Fibromiyalji
Ürtiker, ekzema
Akne
Akne rozase (Gül Hastalığı)
Huzursuz mesane (İnterstisyel sistit)
Huzursuz bacak sendromu
Kronik prostatit (kültür negatif)
Reflü olgularının önemli bir bölümü “NERD” (Endoskopide yara izlenmeyen reflü, “Hassas özefagus”)